KMC 3: counting and manipulating k-mer statistics

机译：KmC 3：计算和操纵k-mer统计数据

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Summary: Counting all k-mers in a given dataset is a standard procedure inmany bioinformatics applications. We introduce KMC3, a significant improvementof the former KMC2 algorithm together with KMC tools for manipulating k-merdatabases. Usefulness of the tools is shown on a few real problems.Availability: Program is freely available athttp://sun.aei.polsl.pl/REFRESH/kmc. Contact: sebastian.deorowicz@polsl.pl

机译：摘要：对给定数据集中的所有k-mers进行计数是许多生物信息学应用程序中的标准程序。我们介绍KMC3，它是对前KMC2算法的重大改进，以及用于处理k-mer数据库的KMC工具。在一些实际问题上显示了该工具的实用性。可用性：该程序可从http://sun.aei.polsl.pl/REFRESH/kmc免费获得。联系人：sebastian.deorowicz@polsl.pl

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作者
Kokot, Marek; Długosz, Maciej; Deorowicz, Sebastian;
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年度 2017
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